Budowa organów dla świętokrzyskiej bazyliki, wiąże się z częścią zadań, jakie zostały wykonane
w ramach rewitalizacji sanktuarium w ostatnich latach. Tak więc po blisko wieku bazylika pw. Trójcy Świętej doczekała sie nowych, pięknych organów. Generalną koncepcję dyspozycji instrumentu zaprojektował Tomasz Staniek z Opatowa. Projekt zrealizowała i instrument zbudowała firma organmistrzowska Zdzisława Mollina z miejscowości Odry w Borach Tucholskich. Budowa organów zamknęła się czasie od października 2006 r. do października 2007 r.

Nowe organy, wykonane w stylu neoklasycystycznym, nawiązują kompozycją do tych, które spłonęły w pożarze w 1914 r. Sam prospekt harmonijnie koresponduje z wystrojem bazyliki i ściśle nawiązuje do tympanonu w ołtarzu głównym.

Poświęcenie instrumentu odbyło się 25 listopada 2007 r. Podczas poświęcenia zagrał prof. Roman Perucki z Gdańska. Projekt prospektu i dyspozycji wykonali Tomasz Staniek i Zdzisław Mollin. Intonacja piszczałek: J. Kukla i Zdzisław Mollin.

Instrument posiada 34 głosy rozmieszczone w czterech sekcjach: trzy manuały oraz pedał. Instrument posiada 25 dzwonów i składa się z blisko 2500 piszczałek. Największa piszczałka drewniana liczy sobie 5 m długości, natomiast największa metalowa 4,5 m długości. Najmniejsza z piszczałek ma długość zaledwie 15 mm. Organy mają trakturę gry mechaniczną oraz trakturę rejestrów elektryczną. Zostały wyposażone w moduł setzer, urządzenie pozwalające zapisać 4000 zestawów głosów tzw. kombinacji. Ułatwia to szybkie zmiany barwy brzmienia instrumentu podczas gry.

Dyspozycja organów:

Manuał I

1. Burdon 16'

2. Pryncypał 8'

3. Gedakt 8'

4. Gemshorn 8'

5. Oktawa 4'

6. Flet minor 4'

7. Kwinta 2 2/3'

8. Superoktawa 2'

9. Mixtura 5x

10. Trompet 8'

Manuał II

1. Kwintadena 8'

2. Flet kryty 8'

3. Flet rurkowy 4'

4. Pryncypał 2'

5. Kwinta 1 1/3'

6. Cymbel 3x

7. Krummhorn 8'

Manuał III

1. Flet pusty 8'

2. Salicet 8'

3. Vox coelestis 8'

4. Prestant 4'

5. Flautino 4'

6. Nasard 2 2/3'

7. Flet leśny 2'

8. Tercflet 1 3/5'

9. Szarf 4x

10. Obój 8'

Pedał

1. Pryncypałbas 16'

2. Subbas 16'

3. Oktawbas 8'

4. Fletbas 8'

5. Chorałbas 4'

6. Mixtura 2 2/3' 5x

7. Puzon 16'

Łączenia: II-I, III-I, III-II, I-P, II-P, III-P,

Tremolo II i III,

Dzwony III man.

Setzer 4000 komb.

Crescendo A i B,

Tutti,

Wył. głosów języczkowych,

Żaluzje na III man.